Es geht um die Rot eingekästchenen Noten.
Ich sehe die zwar nicht, aber grundsätzlich ist der Handsatz unabhängig von den Notenwerten. Für manche rhythmischen Figuren bietet sich allerdings ein bestimmter Handsatz an, soweit scheinst du aber noch nicht zu sein. Nach deiner Beschreibung spielst du Sechzehntel als Einzelschläge im Wechsel und bist unsicher, welche Hand nach einer Pause dran ist und warum.
Vielleicht hilft dies: Dort, wo eine Pause notiert ist, schlägst du im Geiste mit der Hand, die gerade dran wäre, auf eine imaginäre Trommel. Dann ergibt sich ganz von selbst, welche Hand den nächsten "echten" Schlag auszuführen hat.